空间与原位组学 · Spatial & In Situ

空间转录组学

在组织切片上按空间坐标捕获表达信息,spot 内的细胞与空间位置一并保留,后续可结合显微图像对目标区域做 cytAssist 精细取样再上机,提高目标区域的空间分辨率。

  • 空间转录组
  • cytAssist
咨询该方案

技术简介

在组织切片上按空间坐标捕获表达信息,spot 内的细胞与空间位置一并保留,后续可结合显微图像对目标区域做 cytAssist 精细取样再上机,提高目标区域的空间分辨率。

适用研究问题

组织结构与空间异质性解析;肿瘤微环境的空间图谱;发育过程的空间表达轨迹;空间域功能注释。

样本要求

新鲜冷冻组织切片、FFPE 组织切片(视方案而定)。

交付内容

空间表达矩阵与质检、空间聚类与空间域识别、空间邻域与去卷积分析、图像配准与标注、原始数据与报告。

Related

空间与原位组学其他服务

同组学的其他 6 项服务,可按课题组合设计。

高清空间转录组

10x Visium HD

把连续组织表面划分为密集的方形小格(bin)分别捕获表达,在保持组织连续性的同时把空间分辨率推进到亚细胞级别,可按 bin 大小灵活调整信息量与灵敏度的平衡。。

  • 高清空间
  • 亚细胞
查看详情 →

空间原位转录组学

10x Xenium In Situ

在组织切片上用携带编码序列的探针原位杂交并逐分子解码,直接对单个细胞做靶向转录组检测,空间定位精确到单细胞水平,适合已知靶标的精细空间分析。。

  • 原位
  • 单细胞级空间
查看详情 →

华大时空转录组

Stereo-seq (MGI Spatial)

以空间分辨的球形微珠阵列在组织上原位捕获分子,单个微珠对应亚细胞级坐标,配合大视场成像可覆盖整张切片并与病理图像精准配准。。

  • 时空转录组
  • 大视场
查看详情 →

华大时空蛋白组

Stereo CITE-seq

在空间转录组同一位点并行检测蛋白标志物,把转录本与蛋白信息在同一空间坐标上对齐,实现 RNA 与蛋白的多模态空间测量。。

  • 时空蛋白
  • 多模态
查看详情 →

空间单细胞蛋白质组学 PCF

CODEX (Photon Cycling Cytometry)

通过荧光染料的光漂白循环逐轮成像,配合抗体条带在原位反复检测数十种蛋白,实现单细胞分辨率的空间多重蛋白成像。。

  • 空间蛋白
  • 多重成像
查看详情 →

空间代谢组

Spatial Metabolomics

在组织原位直接检测与定位代谢物,把代谢信息与其所在组织结构和细胞邻域对应起来,突破常规代谢组只能给出整体样本读数的限制。。

  • 原位代谢
  • 空间分布
查看详情 →

需要 空间转录组学 的方案与报价?

提供课题背景与样本信息,我们给出技术路线建议、样本要求确认与交付清单。