微生物组学 · Microbiomics

单菌基因组和原核转录组

对纯化单菌做全基因组测序完成组装与注释，同时对该菌做转录组测序，两套数据联合起来把基因型与表达型对应起来，解释菌株的代谢能力与调控状态。

菌株功能基因与耐药基因解析；特定代谢途径的基因验证；菌株在不同环境下的表达调控；合成生物学菌株的功能表征。

纯培养单菌（需保证纯度）、菌体 DNA 与 RNA 分别制备。

基因组组装与注释、基因功能分类、原核转录本定量与差异表达、基因型-表达型联合分析、原始数据与报告。

微生物组学其他服务

同组学的其他 4 项服务，可按课题组合设计。

针对肿瘤组织中含量极低的微生物信号做专项检测，通过严格对照与去污染策略区分真实微生物序列与背景噪声，并给出菌种组成与丰度，刻画肿瘤微环境中的微生物定植情况。。

不对样本中的微生物做单菌分离，直接提取环境总 DNA 建库测序，同时获得群落的物种组成与功能基因信息，通过 binning 还能还原出部分未培养微生物的基因组草图。。

对细菌 16S 或真菌 ITS 区域的保守区段做高深度扩增测序，基于序列变异构建群落组成谱，计算 α/β 多样性并做差异菌群与标志物种分析，是菌群研究的标准入口方案。。

扩增并测序 16S rRNA 基因全长序列，保留多个可变区的信息，可结合现代分类数据库在物种水平甚至菌株水平做精确鉴定与系统发育分析。。

提供课题背景与样本信息，我们给出技术路线建议、样本要求确认与交付清单。