技术简介
用抗体免疫沉淀特定 RNA 结合蛋白及其结合的 RNA 复合物，经交联与片段化后测序，获得该蛋白的靶标 RNA 谱；CLIP 类方法在此基础上通过交联位点把结合位置精确到单碱基。
表观组学 · Epigenomics
用抗体免疫沉淀特定 RNA 结合蛋白及其结合的 RNA 复合物，经交联与片段化后测序，获得该蛋白的靶标 RNA 谱；CLIP 类方法在此基础上通过交联位点把结合位置精确到单碱基。
用抗体免疫沉淀特定 RNA 结合蛋白及其结合的 RNA 复合物，经交联与片段化后测序，获得该蛋白的靶标 RNA 谱；CLIP 类方法在此基础上通过交联位点把结合位置精确到单碱基。
RNA 结合蛋白的靶标鉴定与调控网络构建；mRNA 稳定性与翻译调控机制；特定蛋白在某一过程中的角色解析。
总 RNA 与细胞裂解液，细胞系与组织均可。
富集峰区与靶标列表、motif 识别、靶标功能富集、差异结合比较、原始数据与报告。
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同组学的其他 8 项服务，可按课题组合设计。
检测 mRNA 上 m⁶A 修饰的分布。MeRIP-seq 通过 m⁶A 抗体富集修饰 RNA 后建库测序，回答「哪些转录本被 m⁶A 标记」；GLORI-seq 采用化学方法在单碱基分辨率定位修饰位点，可进一步叠加突变辅助定位提高分辨率。
测定 DNA 上的 5-甲基胞嘧啶分布。全基因组甲基化测序（WGBS）经亚硫酸氢盐转化后建库测序，可获得全基因组单碱基分辨率甲基化图谱；目标区域甲基化针对指定位点做高深度覆盖，适合已知位点的验证与随访。
用特异性抗体沉淀目标蛋白或组蛋白修饰结合的 DNA 片段，经建库测序获得全基因组位点分布，是解析蛋白-DNA 互作与组蛋白修饰图谱的经典方法，可与对照样本比较识别差异结合位点。。
利用 Tn5 转座酶优先切割开放染色质并插入测序接头，通过测序读段的位置推断全基因组可及区域。信号强弱反映染色质开放程度，结合 motif 分析还可反推转录因子在开放区的潜在足迹。
在完整细胞核内用转座酶直接切割与目标蛋白结合的染色质并插入接头，无需甲醛交联，背景低、起始量需求小，可在低细胞数样本中定位组蛋白修饰与转录因子结合位点。。
对样本中的 T 细胞与 B 细胞免疫受体重排区域进行扩增测序，通过 V(D)J 重组片段比对还原克隆型序列，实现免疫组库的定量刻画与克隆谱追踪。。
采用固定化转座酶在活细胞或组织中捕获与转录因子结合的开放 DNA 片段，保留细胞核内的真实微环境与共调控关系，定位精度高，可与表观修饰和表达数据联合构建调控网络。。
在细胞核内固定并裂解染色质后交联近邻片段，经限制性内切酶消化、末端修复与连接后建库测序，以配对末端信息重建全基因组三维接触频率，识别拓扑关联域等空间结构。。
提供课题背景与样本信息，我们给出技术路线建议、样本要求确认与交付清单。